با توجه به اینکه معلمان شاغل در مدارس غیردولتی مشمول قانون کار هستند، در صورت تعرض به حقوق آنان، رسیدگی باید از طریق مراجع پیشبینیشده در قانون کار صورت گیرد. بنابراین، در صورت بروز اختلاف میان معلم و کارفرما، حلوفصل موضوع از طریق نهادهای میانجی و مراجع حل اختلاف کارگر و کارفرما انجام میشود.
در وهله نخست، نهادهایی نظیر شورای اسلامی کار و انجمنهای صنفی بهعنوان میانجی برای حلوفصل اختلافات وارد عمل میشوند. در صورتی که این نهادها موفق به ایجاد صلح و سازش نشوند، موضوع به هیئتهای تشخیص و سپس حل اختلاف ادارات کار ارجاع داده میشود.
پس از رسیدگی و صدور رأی قطعی از سوی این هیئتها، اختلاف پایان مییابد. آرای قطعی صادره دارای اعتبار قانونی و قدرت اجرایی هستند و اجرای آنها مانند احکام صادرشده از دادگاهها، بر عهده اجرای احکام مدنی دادگستری محل خواهد بود.
طرح دعوی در این هیئتها مستلزم تنظیم دادخواست رسمی و رعایت تشریفاتی است که در آیین دادرسی کار مشخص شدهاند. بنابراین، هر معلمی در مدارس غیردولتی که با تضییع حقوقی نظیر عدم پرداخت دستمزد، بیمهنشدن، اخراج غیرقانونی و موارد مشابه مواجه شود، میتواند با مراجعه به مراجع حل اختلاف اداره کار، علیه کارفرما طرح دعوی نماید.